人類的歷史源遠流長，由發展文明之今已有過萬年歷史。唐太宗曾經説過：以古為鏡，可以知興替。學習人類的歷史，除了可以飲水思源外，亦可以從過去中學習，避免重蹈覆徹。

雖然數碼西遊的旅程經已完結，但Q小子依然感到意猶未盡，吵著要A博士帶領他們再來一趟旅行！A博士最終妥協，並拿出了他的法寶——時光機！一陣亂流過後，一行人落在了一處河谷裏。可是，A博士看似無心的一個舉動，卻意外招來遠古生物的攻擊？！究竟他們的旅程會如何發展下去？